More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0813 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  100 
 
 
264 aa  548  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  36.02 
 
 
238 aa  159  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  35.75 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  37.21 
 
 
240 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  36.65 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  39.38 
 
 
233 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  35.45 
 
 
251 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  32.23 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  40.31 
 
 
250 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  32.5 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  37.2 
 
 
241 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  35.77 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  35.37 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  36.28 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  37.5 
 
 
247 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  35.91 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  34.55 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  32.77 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  41.43 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  36.28 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  36.82 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  35.17 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  34.53 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  34.55 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  35.21 
 
 
255 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  40 
 
 
252 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  35.07 
 
 
256 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  35.32 
 
 
241 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  32.33 
 
 
259 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  32.53 
 
 
259 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  35.24 
 
 
237 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  32.74 
 
 
252 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  38.03 
 
 
267 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  35.94 
 
 
255 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  34.29 
 
 
238 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  35.14 
 
 
256 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  35.42 
 
 
272 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  32.13 
 
 
254 aa  121  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  33.2 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  36.02 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  34.15 
 
 
269 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  35.32 
 
 
237 aa  119  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  32.11 
 
 
238 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  31.7 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  37.33 
 
 
239 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  33.47 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  35.21 
 
 
233 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  30.36 
 
 
253 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  35.65 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  36.11 
 
 
274 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  33.78 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  36.19 
 
 
231 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1900  glutamine amidotransferase-like protein  34.1 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720243  normal  0.134841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  33.02 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  31.62 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  35.55 
 
 
236 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  30.1 
 
 
312 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  35.55 
 
 
236 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  34.58 
 
 
264 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  33.48 
 
 
251 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  35.55 
 
 
236 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  33.64 
 
 
250 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  33.48 
 
 
240 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  33.48 
 
 
240 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  32.65 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  37.96 
 
 
250 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 
238 aa  111  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0121  peptidase C26  32.27 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  33.03 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  35.15 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  35.6 
 
 
235 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  35.71 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  30.52 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  31.36 
 
 
254 aa  109  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  31.08 
 
 
253 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  30.52 
 
 
278 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  30.52 
 
 
278 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2762  peptidase C26  33.87 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126803  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  33.16 
 
 
242 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  39.06 
 
 
238 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  30.05 
 
 
253 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  32.88 
 
 
230 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  33.64 
 
 
264 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  30.05 
 
 
253 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  30.7 
 
 
254 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  31.16 
 
 
253 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  30.05 
 
 
254 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  31.78 
 
 
244 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  32.41 
 
 
249 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  32.44 
 
 
279 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  34.42 
 
 
264 aa  105  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  31.22 
 
 
279 aa  106  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  30.99 
 
 
407 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  29.95 
 
 
237 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  33.95 
 
 
262 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  32.78 
 
 
409 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  29.58 
 
 
253 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4023  peptidase C26  31.75 
 
 
256 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.15 
 
 
255 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  32.56 
 
 
245 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>