271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2887 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2887  peptidase C26  100 
 
 
221 aa  448  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.550139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  38.38 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  36.65 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  39.39 
 
 
253 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  41.11 
 
 
251 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  41.48 
 
 
256 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  41.11 
 
 
240 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  41.11 
 
 
240 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  37.26 
 
 
247 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  43.71 
 
 
231 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  41.33 
 
 
260 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  31.58 
 
 
242 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  38.46 
 
 
237 aa  102  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  40.22 
 
 
280 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  32.37 
 
 
233 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  33.02 
 
 
241 aa  101  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  30.99 
 
 
238 aa  100  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  36.32 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  37.98 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  36.36 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  38.46 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  36.56 
 
 
250 aa  95.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  42.26 
 
 
272 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  36.56 
 
 
250 aa  95.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  37.97 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  33.18 
 
 
277 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  36.67 
 
 
242 aa  92.4  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  35.65 
 
 
281 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  30.88 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  29.8 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  31.38 
 
 
258 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1887  peptidase C26  35.19 
 
 
281 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192004  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  32.59 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  29.61 
 
 
241 aa  90.1  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  37.36 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1536  peptidase C26  34.4 
 
 
276 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  36.23 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  31.94 
 
 
238 aa  89  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  36.25 
 
 
233 aa  89  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  40.35 
 
 
238 aa  87.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  34.72 
 
 
254 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  37.06 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  32.37 
 
 
230 aa  87  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  36.19 
 
 
279 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  29.19 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  30.77 
 
 
240 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1798  peptidase C26  36.26 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  31.53 
 
 
285 aa  85.5  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  35.41 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  35.5 
 
 
255 aa  85.1  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1229  peptidase C26  32.86 
 
 
259 aa  84.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.121618 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  30.95 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  30.91 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  32.37 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  27.32 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  32.95 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  37.21 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  34.65 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  30.09 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  30.84 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  34.3 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  32.37 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  30.84 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  34.86 
 
 
255 aa  82  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  36.08 
 
 
260 aa  82  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  34.58 
 
 
268 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  30.26 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2669  peptidase C26  32.11 
 
 
288 aa  82  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0275908  normal  0.209518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  30.81 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  34.5 
 
 
264 aa  82  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  31.64 
 
 
278 aa  81.6  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  35.27 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  34.64 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  35.27 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  31.64 
 
 
278 aa  81.6  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  33.17 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  34.93 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  27.27 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  34.1 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  33.33 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  31.1 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  34.58 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  32.69 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  35.55 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  34.81 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  35.55 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  32.14 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  32.38 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  33.18 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  31.44 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  30.77 
 
 
259 aa  79  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  32.07 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  33.01 
 
 
268 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  35.15 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  32.85 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  31.07 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  30.14 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  34.11 
 
 
279 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>