More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1013 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1013  acetyl-CoA acetyltransferases  100 
 
 		 404 aa  784    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0223058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23240  acetyl-CoA acetyltransferase  70.78 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4073  acetyl-CoA acetyltransferases  69.27 
 
 		 399 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4593  acetyl-CoA acetyltransferase  67.41 
 
 		 404 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3849  acetyl-CoA acetyltransferase  67.49 
 
 		 405 aa  532  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13000  acetyl-CoA acetyltransferase  69.92 
 
 		 391 aa  521  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0619  acetyl-CoA acetyltransferase  68.08 
 
 		 407 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0875  thiolase  61.22 
 
 		 391 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0626  acetyl-CoA acetyltransferases  63.68 
 
 		 391 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0380375  decreased coverage  0.00188207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7930  3-oxoadipyl-CoA thiolase  60.87 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155909  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  51.97 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0164  acetyl-CoA acetyltransferase  52.03 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  51.48 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.55 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.87 
 
 		 403 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  51.86 
 
 		 404 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.02 
 
 		 401 aa  358  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  49.63 
 
 		 402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  47.97 
 
 		 401 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0115  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.286312  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  49.12 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.26 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49 
 
 		 402 aa  350  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.63 
 
 		 402 aa  349  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.76 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.5 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.64 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  46.4 
 
 		 403 aa  345  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.03 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  47 
 
 		 400 aa  343  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.77 
 
 		 401 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.53 
 
 		 412 aa  342  5e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  48.4 
 
 		 408 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.63 
 
 		 401 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.14 
 
 		 402 aa  342  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  42.43 
 
 		 404 aa  340  4e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.01 
 
 		 405 aa  338  7e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.26 
 
 		 401 aa  338  8e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.28 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  51.75 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.76 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  45.25 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.76 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.25 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1034  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.25 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0157191  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.75 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.76 
 
 		 401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  48.28 
 
 		 409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.03 
 
 		 400 aa  336  5e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0226  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.5 
 
 		 400 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.25 
 
 		 400 aa  335  9e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.75 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.51 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.5 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.78 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.5 
 
 		 402 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.88 
 
 		 402 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.27 
 
 		 400 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.53 
 
 		 401 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  51.85 
 
 		 412 aa  329  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.64 
 
 		 401 aa  329  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  43.39 
 
 		 399 aa  329  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.14 
 
 		 401 aa  328  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  46.98 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.98 
 
 		 400 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.01 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.77 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.4 
 
 		 401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.76 
 
 		 406 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.51 
 
 		 401 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.38 
 
 		 404 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.78 
 
 		 401 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.73 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  42.5 
 
 		 400 aa  323  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.03 
 
 		 401 aa  323  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.38 
 
 		 414 aa  322  6e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.51 
 
 		 406 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.16 
 
 		 401 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.41 
 
 		 402 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.02 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0650  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.52 
 
 		 401 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.67 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1198  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.03 
 
 		 401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.5 
 
 		 400 aa  319  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  318  9e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.73 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1377  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.24 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388007  normal  0.268922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.17 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  48.05 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.81 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1847  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.38 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.227996  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5019  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.24 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.582505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0916  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.14 
 
 		 400 aa  317  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4346  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.98 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.269292  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.27 
 
 		 400 aa  316  6e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.9 
 
 		 402 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0375  thiolase  46.52 
 
 		 401 aa  315  7e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000288796  hitchhiker  0.0000265962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>