More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0875 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0875  thiolase  100 
 
 
391 aa  772    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13000  acetyl-CoA acetyltransferase  75.7 
 
 
391 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0626  acetyl-CoA acetyltransferases  76.49 
 
 
391 aa  570  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0380375  decreased coverage  0.00188207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7930  3-oxoadipyl-CoA thiolase  72.63 
 
 
391 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155909  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0619  acetyl-CoA acetyltransferase  63 
 
 
407 aa  488  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23240  acetyl-CoA acetyltransferase  62.05 
 
 
400 aa  480  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554052  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4593  acetyl-CoA acetyltransferase  59.65 
 
 
404 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1013  acetyl-CoA acetyltransferases  61.22 
 
 
404 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0223058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3849  acetyl-CoA acetyltransferase  59.05 
 
 
405 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4073  acetyl-CoA acetyltransferases  59.8 
 
 
399 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  59.65 
 
 
404 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  55.48 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  54.77 
 
 
398 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  56.33 
 
 
402 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0115  acetyl-CoA acetyltransferase  55.01 
 
 
384 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.286312  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55 
 
 
405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.25 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.25 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.25 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.25 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.25 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.25 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.25 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.25 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.25 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.25 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0164  acetyl-CoA acetyltransferase  56.09 
 
 
394 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.36 
 
 
400 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
401 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.61 
 
 
400 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
403 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.25 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.22 
 
 
402 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.87 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  53.87 
 
 
402 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.03 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.62 
 
 
400 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.25 
 
 
400 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  51.63 
 
 
401 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.03 
 
 
401 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.86 
 
 
400 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  54.98 
 
 
402 aa  396  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.86 
 
 
400 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2852  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
400 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0252423  normal  0.507023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.11 
 
 
400 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.11 
 
 
400 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00256596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.48 
 
 
401 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.25 
 
 
400 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.25 
 
 
400 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.62 
 
 
402 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  55.25 
 
 
399 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.3 
 
 
404 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.36 
 
 
401 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.48 
 
 
401 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.75 
 
 
399 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0472  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
400 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0423781  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.08 
 
 
401 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.62 
 
 
400 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
400 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.5 
 
 
400 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53 
 
 
400 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.48 
 
 
401 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2998  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
400 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.5 
 
 
400 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0447  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
400 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5246  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.61 
 
 
400 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4717  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.61 
 
 
406 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56 
 
 
400 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.48 
 
 
401 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5368  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
400 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  51.64 
 
 
400 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.5 
 
 
400 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56 
 
 
401 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.25 
 
 
400 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.72 
 
 
401 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.61 
 
 
400 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000820943  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.12 
 
 
402 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.25 
 
 
400 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.37 
 
 
400 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.74 
 
 
401 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.84 
 
 
402 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.5 
 
 
400 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.41 
 
 
401 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.98 
 
 
401 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
399 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.12 
 
 
403 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.12 
 
 
402 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.75 
 
 
400 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.11 
 
 
401 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.64 
 
 
401 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.48 
 
 
401 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.27 
 
 
397 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0916  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.86 
 
 
400 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>