More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0115 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0115  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 384 aa  771    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.286312  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0164  acetyl-CoA acetyltransferase  61.18 
 
 		 394 aa  451  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0875  thiolase  55.01 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13000  acetyl-CoA acetyltransferase  55.27 
 
 		 391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0626  acetyl-CoA acetyltransferases  54.01 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0380375  decreased coverage  0.00188207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7930  3-oxoadipyl-CoA thiolase  54.26 
 
 		 391 aa  381  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155909  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.62 
 
 		 401 aa  363  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23240  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 400 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  47.61 
 
 		 401 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.23 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1013  acetyl-CoA acetyltransferases  49.49 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0223058  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.73 
 
 		 412 aa  352  5e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4073  acetyl-CoA acetyltransferases  48.97 
 
 		 399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.38 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3849  acetyl-CoA acetyltransferase  47.34 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.74 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.74 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.74 
 
 		 401 aa  349  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.74 
 
 		 401 aa  349  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 		 402 aa  349  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0619  acetyl-CoA acetyltransferase  50.5 
 
 		 407 aa  348  7e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4593  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.13 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  47.98 
 
 		 398 aa  345  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  45.11 
 
 		 404 aa  345  8.999999999999999e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  47.73 
 
 		 398 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  47.73 
 
 		 400 aa  344  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 400 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.36 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.39 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  51.51 
 
 		 404 aa  342  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.75 
 
 		 401 aa  343  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.74 
 
 		 399 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.74 
 
 		 401 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.5 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  47.63 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  48.23 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.37 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.23 
 
 		 404 aa  339  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.89 
 
 		 401 aa  338  8e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  49.25 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.37 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 		 398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.6 
 
 		 397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 400 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 400 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 400 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 400 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 405 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 405 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 405 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 405 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 400 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 400 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 400 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.87 
 
 		 401 aa  334  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 400 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 399 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 		 406 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.49 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.36 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.24 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.62 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.37 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.87 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.61 
 
 		 405 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 		 400 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.59 
 
 		 399 aa  332  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.74 
 
 		 402 aa  332  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.36 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.11 
 
 		 402 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.1 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.11 
 
 		 400 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.61 
 
 		 402 aa  331  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.36 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3081  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.74 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.426252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.61 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.24 
 
 		 401 aa  329  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 		 400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.36 
 
 		 400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.12 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.84 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  49.25 
 
 		 399 aa  328  8e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.46 
 
 		 400 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.97 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.46 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.74 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.2 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.85 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.47 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.99 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.62 
 
 		 400 aa  326  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1198  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.61 
 
 		 401 aa  325  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.48 
 
 		 401 aa  325  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>