More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0164 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0164  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 394 aa  775    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0115  acetyl-CoA acetyltransferase  61.18 
 
 		 384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.286312  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13000  acetyl-CoA acetyltransferase  57.36 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0875  thiolase  56.09 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23240  acetyl-CoA acetyltransferase  53.47 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0626  acetyl-CoA acetyltransferases  55.64 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0380375  decreased coverage  0.00188207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7930  3-oxoadipyl-CoA thiolase  56.09 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155909  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1013  acetyl-CoA acetyltransferases  52.03 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0223058  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4593  acetyl-CoA acetyltransferase  49.13 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4073  acetyl-CoA acetyltransferases  49.87 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3849  acetyl-CoA acetyltransferase  48.5 
 
 		 405 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0619  acetyl-CoA acetyltransferase  51.24 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  48.87 
 
 		 398 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  49.12 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  47.34 
 
 		 399 aa  345  7e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.12 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.62 
 
 		 402 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.87 
 
 		 402 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  47.36 
 
 		 399 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.37 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 		 401 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.85 
 
 		 399 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.38 
 
 		 401 aa  332  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.1 
 
 		 401 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.46 
 
 		 406 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.98 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.1 
 
 		 401 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.1 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.73 
 
 		 401 aa  329  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.98 
 
 		 406 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.84 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.86 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  45.32 
 
 		 400 aa  325  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.86 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43 
 
 		 401 aa  322  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  47.32 
 
 		 411 aa  322  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.87 
 
 		 400 aa  322  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.62 
 
 		 401 aa  322  7e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.07 
 
 		 401 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.6 
 
 		 401 aa  322  8e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.24 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.73 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.99 
 
 		 402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.49 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.84 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.73 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.45 
 
 		 406 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.5 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1034  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.84 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0157191  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.5 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.37 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.73 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.56 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.37 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.23 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2398  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.35 
 
 		 404 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.48 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  49.12 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.37 
 
 		 402 aa  316  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.19 
 
 		 406 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.01 
 
 		 399 aa  316  6e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.3 
 
 		 401 aa  315  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.73 
 
 		 401 aa  315  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.06 
 
 		 401 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.73 
 
 		 402 aa  315  9e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.98 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.73 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.23 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.23 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.23 
 
 		 405 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.23 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1847  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.38 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.227996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.23 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.23 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.23 
 
 		 405 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.98 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.23 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.23 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.23 
 
 		 405 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.01 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.23 
 
 		 405 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.25 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.57 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.23 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.07 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.96 
 
 		 401 aa  312  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  41.16 
 
 		 404 aa  312  6.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.98 
 
 		 405 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.8 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2813  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.98 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1377  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.98 
 
 		 400 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388007  normal  0.268922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4346  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.98 
 
 		 400 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.269292  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.33 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.4 
 
 		 414 aa  311  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.5 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0650  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.86 
 
 		 401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.22 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>