More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4073 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3849  acetyl-CoA acetyltransferase  90.73 
 
 
405 aa  729    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4593  acetyl-CoA acetyltransferase  90.75 
 
 
404 aa  728    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4073  acetyl-CoA acetyltransferases  100 
 
 
399 aa  800    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23240  acetyl-CoA acetyltransferase  69.11 
 
 
400 aa  549  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554052  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1013  acetyl-CoA acetyltransferases  69.27 
 
 
404 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0223058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0619  acetyl-CoA acetyltransferase  65.34 
 
 
407 aa  528  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13000  acetyl-CoA acetyltransferase  67.86 
 
 
391 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0875  thiolase  59.8 
 
 
391 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0626  acetyl-CoA acetyltransferases  61.79 
 
 
391 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0380375  decreased coverage  0.00188207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7930  3-oxoadipyl-CoA thiolase  58.12 
 
 
391 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155909  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0164  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
394 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  47.5 
 
 
401 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  46.98 
 
 
403 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  48.64 
 
 
402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0115  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.286312  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.88 
 
 
401 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.88 
 
 
401 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  49.38 
 
 
402 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.64 
 
 
402 aa  346  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.14 
 
 
401 aa  345  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.55 
 
 
412 aa  345  6e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.13 
 
 
401 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.58 
 
 
424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.39 
 
 
401 aa  342  5.999999999999999e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  49.5 
 
 
404 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.14 
 
 
400 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  47.12 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.52 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.65 
 
 
401 aa  337  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  48.27 
 
 
408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.65 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  42.43 
 
 
404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.15 
 
 
401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 
411 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  48.02 
 
 
409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.4 
 
 
400 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.4 
 
 
402 aa  334  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  44.28 
 
 
399 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.64 
 
 
401 aa  333  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.91 
 
 
400 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.16 
 
 
401 aa  332  8e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.4 
 
 
400 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.52 
 
 
404 aa  331  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.16 
 
 
401 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.64 
 
 
402 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.16 
 
 
401 aa  332  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.16 
 
 
401 aa  331  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.42 
 
 
403 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1169  acetyl-CoA acetyltransferase  44.31 
 
 
400 aa  330  3e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.178123 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.2 
 
 
401 aa  329  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.88 
 
 
400 aa  329  6e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.39 
 
 
401 aa  328  7e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.66 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.16 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.5 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.16 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.52 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.63 
 
 
400 aa  327  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.4 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  45.14 
 
 
398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.65 
 
 
399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 
398 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  42.04 
 
 
400 aa  326  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.52 
 
 
401 aa  325  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.77 
 
 
401 aa  325  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.15 
 
 
400 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.41 
 
 
400 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.06 
 
 
404 aa  324  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1236  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 
400 aa  325  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.439957  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.88 
 
 
400 aa  323  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.15 
 
 
406 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 
412 aa  324  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.27 
 
 
402 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.66 
 
 
401 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.64 
 
 
400 aa  323  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.91 
 
 
400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
405 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.4 
 
 
402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
400 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
405 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
405 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
405 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
405 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
400 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
400 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
400 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
400 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
400 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
400 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.16 
 
 
401 aa  319  7e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.15 
 
 
400 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.66 
 
 
401 aa  318  9e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0226  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.66 
 
 
400 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46 
 
 
406 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.16 
 
 
400 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.79 
 
 
402 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.16 
 
 
402 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.17 
 
 
400 aa  315  9e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.41 
 
 
400 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.55 
 
 
404 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>