More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23240 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23240  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
400 aa  799    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554052  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4593  acetyl-CoA acetyltransferase  69.31 
 
 
404 aa  559  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3849  acetyl-CoA acetyltransferase  68.49 
 
 
405 aa  551  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4073  acetyl-CoA acetyltransferases  69.11 
 
 
399 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1013  acetyl-CoA acetyltransferases  70.78 
 
 
404 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0223058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0619  acetyl-CoA acetyltransferase  65.5 
 
 
407 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13000  acetyl-CoA acetyltransferase  64.62 
 
 
391 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0875  thiolase  62.05 
 
 
391 aa  480  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0626  acetyl-CoA acetyltransferases  61.03 
 
 
391 aa  450  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0380375  decreased coverage  0.00188207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7930  3-oxoadipyl-CoA thiolase  60.26 
 
 
391 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155909  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 
401 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0164  acetyl-CoA acetyltransferase  53.47 
 
 
394 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 
403 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  51.39 
 
 
402 aa  364  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.39 
 
 
401 aa  362  8e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
402 aa  360  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.99 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0115  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
384 aa  356  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.286312  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  49.25 
 
 
398 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.25 
 
 
401 aa  353  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  47.61 
 
 
398 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  50.37 
 
 
411 aa  351  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  47.36 
 
 
398 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  51.26 
 
 
404 aa  349  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  43.18 
 
 
404 aa  347  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.49 
 
 
401 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.49 
 
 
424 aa  343  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.65 
 
 
405 aa  343  4e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  48.38 
 
 
408 aa  342  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.99 
 
 
401 aa  342  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.61 
 
 
400 aa  342  8e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.37 
 
 
401 aa  342  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.13 
 
 
401 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.13 
 
 
401 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  48.5 
 
 
409 aa  342  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.13 
 
 
401 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.17 
 
 
412 aa  341  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.5 
 
 
401 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.98 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.75 
 
 
400 aa  339  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.88 
 
 
401 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.36 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.63 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.61 
 
 
400 aa  335  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.6 
 
 
401 aa  335  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.24 
 
 
400 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.38 
 
 
400 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.24 
 
 
401 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.48 
 
 
401 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.36 
 
 
400 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.36 
 
 
400 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.97 
 
 
397 aa  333  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.35 
 
 
400 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  51.36 
 
 
412 aa  332  6e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.61 
 
 
402 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.75 
 
 
403 aa  332  8e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  43.11 
 
 
400 aa  331  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.1 
 
 
401 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.12 
 
 
402 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.25 
 
 
400 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.35 
 
 
400 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.34 
 
 
401 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.24 
 
 
402 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.01 
 
 
399 aa  329  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.87 
 
 
402 aa  329  6e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.1 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.01 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1169  acetyl-CoA acetyltransferase  45.23 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.178123 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.35 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.24 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
400 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
400 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
405 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
400 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
400 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
400 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
400 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.58 
 
 
400 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.1 
 
 
402 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
400 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.97 
 
 
402 aa  325  7e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
400 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
405 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.5 
 
 
406 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
405 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
405 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.86 
 
 
405 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.48 
 
 
401 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0226  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.36 
 
 
400 aa  325  9e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.45 
 
 
400 aa  324  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.85 
 
 
400 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.1 
 
 
402 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1236  acetyl-CoA acetyltransferase  44.97 
 
 
400 aa  324  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.439957  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.25 
 
 
400 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.82 
 
 
401 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.37 
 
 
400 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.01 
 
 
400 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1198  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.61 
 
 
401 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>