178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0935 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0935  asparagine synthase  100 
 
 		 339 aa  697    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.213024 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1452  asparagine synthase  29.64 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0528  asparagine synthase  28.2 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0216136  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  30.08 
 
 		 537 aa  119  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  30.39 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  30.55 
 
 		 492 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1537  asparagine synthase  28.67 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0538589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  28.17 
 
 		 554 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  31.95 
 
 		 503 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.35 
 
 		 536 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  27.6 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  27.4 
 
 		 554 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  28.07 
 
 		 554 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.07 
 
 		 554 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  28.07 
 
 		 554 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  28.07 
 
 		 554 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  28.07 
 
 		 554 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  28.07 
 
 		 554 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  28.21 
 
 		 554 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.65 
 
 		 512 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  28.21 
 
 		 554 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  28.21 
 
 		 554 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  27.92 
 
 		 554 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  27.92 
 
 		 554 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  27.78 
 
 		 554 aa  99.4  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  26.99 
 
 		 554 aa  99.4  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  27.78 
 
 		 554 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  26.99 
 
 		 554 aa  99.4  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  26.99 
 
 		 554 aa  99.4  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  27.78 
 
 		 554 aa  99  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  29.41 
 
 		 554 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  27.17 
 
 		 554 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  26.55 
 
 		 554 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  26.89 
 
 		 554 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  28.75 
 
 		 562 aa  96.7  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  26.89 
 
 		 554 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0733  asparagine synthase  27.78 
 
 		 246 aa  94  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00503578  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1015  asparagine synthase  27.52 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0855  asparagine synthase  27.98 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.489372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0834  hypothetical protein  27.59 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  27.72 
 
 		 558 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  28.1 
 
 		 556 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.99 
 
 		 530 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  26.58 
 
 		 554 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  26.58 
 
 		 554 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  28.96 
 
 		 638 aa  87.8  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  28.37 
 
 		 537 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  26.83 
 
 		 557 aa  86.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  29.37 
 
 		 554 aa  86.3  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  31.98 
 
 		 554 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  31.98 
 
 		 554 aa  85.9  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  28.32 
 
 		 488 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  27.3 
 
 		 555 aa  85.9  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  28.62 
 
 		 554 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  29.75 
 
 		 552 aa  85.9  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.52 
 
 		 513 aa  85.9  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  27.99 
 
 		 554 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  25.09 
 
 		 563 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  25.52 
 
 		 596 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  25.09 
 
 		 563 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0774  asparagine synthase  27.65 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.780616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  30.04 
 
 		 555 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  27.19 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  29.54 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  29.54 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  31.58 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1754  asparagine synthase  25.83 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  31.58 
 
 		 554 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  31.58 
 
 		 554 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  26.9 
 
 		 553 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.95 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1295  asparagine synthase  27.57 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.04 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  28.07 
 
 		 554 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.61 
 
 		 514 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  26.3 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  26.09 
 
 		 554 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  26.49 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  24.77 
 
 		 592 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  27.62 
 
 		 571 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  24.05 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  26.49 
 
 		 554 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3539  asparagine synthase  27.85 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  26.84 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.74 
 
 		 528 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2921  asparagine synthase family protein  26.18 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.458413  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  23.67 
 
 		 563 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  24.64 
 
 		 573 aa  77  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1987  asparagine synthase  23.77 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  27.01 
 
 		 564 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.49 
 
 		 554 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  28.73 
 
 		 530 aa  71.2  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0465  asparagine synthase  25.79 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371494  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0611  asparagine synthase  23.29 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0500916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0732  asparagine synthase  23.97 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6993  asparagine synthase  28.7 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0213  asparagine synthase  24.69 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.08 
 
 		 510 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.08 
 
 		 510 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.08 
 
 		 510 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>