166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0611 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0611  asparagine synthase  100 
 
 		 389 aa  752    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0500916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1987  asparagine synthase  57.63 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0732  asparagine synthase  56.14 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1754  asparagine synthase  54.57 
 
 		 387 aa  333  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3539  asparagine synthase  52.21 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1015  asparagine synthase  38.46 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  32.32 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0774  asparagine synthase  36.52 
 
 		 332 aa  135  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.780616  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0855  asparagine synthase  37.24 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.489372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1295  asparagine synthase  37.08 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.14 
 
 		 530 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0834  hypothetical protein  34.78 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.3 
 
 		 513 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0733  asparagine synthase  32.46 
 
 		 246 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00503578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.6 
 
 		 514 aa  106  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.8 
 
 		 513 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.85 
 
 		 513 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0465  asparagine synthase  33.33 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371494  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  27.73 
 
 		 498 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  25.14 
 
 		 562 aa  76.6  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  25.72 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  26.59 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  26.61 
 
 		 555 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0935  asparagine synthase  23.29 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.213024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  29.1 
 
 		 498 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  24.4 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.88 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  25.66 
 
 		 554 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.86 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  25.44 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  25.66 
 
 		 554 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  25.66 
 
 		 554 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  25.95 
 
 		 554 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6993  asparagine synthase  30 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  25.73 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  27.84 
 
 		 554 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  27.84 
 
 		 554 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  27.84 
 
 		 554 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  25.66 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  27.13 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0683  asparagine synthase  31.89 
 
 		 582 aa  66.6  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  25.69 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1466  asparagine synthase  23.18 
 
 		 251 aa  66.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  25.97 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  26.21 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  27.45 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  25.57 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  26.35 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  27.53 
 
 		 552 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  24.2 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  23.84 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  24.2 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  25.71 
 
 		 554 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  23.84 
 
 		 554 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.03 
 
 		 536 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  23.84 
 
 		 554 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  25.44 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  24.78 
 
 		 555 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  23.35 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  25.15 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2921  asparagine synthase family protein  23.88 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.458413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  25 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  26.32 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  25.31 
 
 		 638 aa  60.1  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  24.53 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  25.7 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  24.28 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  24.56 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  24.28 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  24.56 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  24.28 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  23.21 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2668  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.27 
 
 		 629 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0183361  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  23.21 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  23.21 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  23.21 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  23.21 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  23.21 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  23.21 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2428  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  30.52 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0680339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  24.63 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.21 
 
 		 554 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  21.67 
 
 		 484 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2520  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32 
 
 		 620 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0134172 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  23.21 
 
 		 554 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  25.63 
 
 		 630 aa  56.6  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  25.94 
 
 		 556 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10620  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  28.85 
 
 		 642 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.295992 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0134  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.27 
 
 		 618 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.92 
 
 		 510 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  26.47 
 
 		 571 aa  53.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2541  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.08 
 
 		 621 aa  53.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  0.489677 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  26.97 
 
 		 594 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  23.25 
 
 		 554 aa  52.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3256  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.39 
 
 		 634 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00445489  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3062  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.64 
 
 		 646 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3348  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.61 
 
 		 643 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.74 
 
 		 633 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2728  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.6 
 
 		 593 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  25.54 
 
 		 556 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>