263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0855 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0855  asparagine synthase  100 
 
 
334 aa  680    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.489372  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1295  asparagine synthase  59.76 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0774  asparagine synthase  58.73 
 
 
332 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.780616  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1015  asparagine synthase  53.99 
 
 
329 aa  344  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0834  hypothetical protein  49.04 
 
 
319 aa  256  4e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0733  asparagine synthase  37.45 
 
 
246 aa  146  6e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00503578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  38.7 
 
 
488 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1754  asparagine synthase  35.85 
 
 
387 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.69 
 
 
530 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0611  asparagine synthase  37.24 
 
 
389 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0500916  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0465  asparagine synthase  36.33 
 
 
468 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371494  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1987  asparagine synthase  36.4 
 
 
366 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35 
 
 
514 aa  122  9e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.82 
 
 
513 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.02 
 
 
513 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.63 
 
 
513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3539  asparagine synthase  36.24 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0732  asparagine synthase  35.89 
 
 
369 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  31.94 
 
 
503 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  35.69 
 
 
498 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  36.32 
 
 
498 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  32.93 
 
 
554 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  32.53 
 
 
554 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  32.53 
 
 
554 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  33.33 
 
 
552 aa  96.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  32.53 
 
 
554 aa  96.3  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  33.19 
 
 
554 aa  96.3  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  31.66 
 
 
554 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  31.6 
 
 
557 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  31.27 
 
 
555 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  31.27 
 
 
554 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  31.27 
 
 
554 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  31.27 
 
 
554 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  31.27 
 
 
554 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  30.54 
 
 
553 aa  92.8  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  30.5 
 
 
554 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0935  asparagine synthase  27.98 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.213024 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  32.49 
 
 
482 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.19 
 
 
484 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  30.12 
 
 
562 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  28.29 
 
 
554 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  29.89 
 
 
554 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  30.89 
 
 
554 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  29.89 
 
 
554 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  28.45 
 
 
554 aa  85.9  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  27.91 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  27.91 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  28.16 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  27.91 
 
 
554 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  28.98 
 
 
554 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  29.65 
 
 
554 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  30.26 
 
 
556 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  27.91 
 
 
554 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  27.91 
 
 
554 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  27.91 
 
 
554 aa  82.8  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  27.76 
 
 
554 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  31.64 
 
 
537 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  29.39 
 
 
556 aa  82.8  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.16 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  27.88 
 
 
554 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  27.76 
 
 
554 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.44 
 
 
536 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  27.88 
 
 
554 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  27.76 
 
 
554 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  28.03 
 
 
554 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  30.09 
 
 
556 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  27.76 
 
 
554 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  27.88 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  27.88 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  27.88 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  27.88 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  27.88 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.88 
 
 
554 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  30.52 
 
 
638 aa  80.5  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  27.88 
 
 
554 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  27.75 
 
 
558 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  28.98 
 
 
555 aa  79.3  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  29.8 
 
 
492 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.12 
 
 
512 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  28.57 
 
 
537 aa  76.3  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.19 
 
 
592 aa  74.7  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  29.56 
 
 
596 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1938  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.21 
 
 
639 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.81 
 
 
633 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.3 
 
 
632 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  28.57 
 
 
543 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  34.81 
 
 
605 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  34.81 
 
 
633 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  34.81 
 
 
633 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  34.81 
 
 
633 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  34.81 
 
 
633 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  34.81 
 
 
633 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  29.57 
 
 
564 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  34.81 
 
 
633 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  34.81 
 
 
633 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  34.81 
 
 
633 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33380  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.73 
 
 
512 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.505962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.81 
 
 
633 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  28.64 
 
 
563 aa  69.3  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.6 
 
 
660 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>