More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33380 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33380  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 		 512 aa  1016    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.505962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0213  asparagine synthase  28.41 
 
 		 503 aa  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  24.16 
 
 		 484 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  29.46 
 
 		 498 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  28.29 
 
 		 498 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  24.41 
 
 		 537 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  26.11 
 
 		 554 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  28.14 
 
 		 638 aa  113  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  25.76 
 
 		 503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  26.53 
 
 		 554 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  26.53 
 
 		 554 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  24.85 
 
 		 562 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  26.32 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.5 
 
 		 627 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  25.68 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  25.68 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  25.68 
 
 		 554 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  25.26 
 
 		 554 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.95 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.95 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.95 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.95 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  25.79 
 
 		 554 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.95 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  28.98 
 
 		 590 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.95 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.95 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  24.94 
 
 		 482 aa  105  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  26.22 
 
 		 555 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  26.29 
 
 		 554 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  26.02 
 
 		 554 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.61 
 
 		 596 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.27 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.41 
 
 		 591 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  27.97 
 
 		 590 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  25.69 
 
 		 552 aa  101  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  24.44 
 
 		 553 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  25 
 
 		 558 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.16 
 
 		 600 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3531  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.88 
 
 		 596 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0213452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1407  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.45 
 
 		 607 aa  98.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.508738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  26.28 
 
 		 554 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.09 
 
 		 598 aa  98.2  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  26.91 
 
 		 537 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  25.12 
 
 		 554 aa  96.7  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  26.65 
 
 		 488 aa  96.7  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  30.03 
 
 		 606 aa  96.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  25.69 
 
 		 554 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  25.12 
 
 		 554 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  31.15 
 
 		 599 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  25.41 
 
 		 554 aa  95.5  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  23.63 
 
 		 557 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  25.12 
 
 		 554 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  25.12 
 
 		 554 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.26 
 
 		 536 aa  95.1  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  25.12 
 
 		 554 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  25.12 
 
 		 554 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.12 
 
 		 554 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  25.12 
 
 		 554 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  25.98 
 
 		 554 aa  94.7  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  25.98 
 
 		 554 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  25.46 
 
 		 554 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  25.98 
 
 		 554 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.64 
 
 		 591 aa  94.4  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  25.92 
 
 		 556 aa  94.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  25.69 
 
 		 554 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  25 
 
 		 554 aa  94  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  25.35 
 
 		 554 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  25.35 
 
 		 554 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  25.35 
 
 		 554 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1633  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.25 
 
 		 590 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  25.35 
 
 		 554 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  25.23 
 
 		 554 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  26.16 
 
 		 596 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  29.78 
 
 		 629 aa  93.2  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3747  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.83 
 
 		 590 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1617  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.96 
 
 		 583 aa  92.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5018  asparagine synthase family amidotransferase  28.27 
 
 		 593 aa  91.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197798  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.37 
 
 		 610 aa  91.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.82 
 
 		 512 aa  91.3  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  25 
 
 		 554 aa  90.9  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  25.18 
 
 		 543 aa  90.9  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  25.58 
 
 		 556 aa  90.5  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  24.88 
 
 		 554 aa  90.5  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.81 
 
 		 595 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3607  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.27 
 
 		 615 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.82 
 
 		 666 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  24.74 
 
 		 556 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2293  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.21 
 
 		 593 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00195658  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25 
 
 		 633 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  25 
 
 		 633 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  25 
 
 		 633 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.43 
 
 		 588 aa  88.2  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25 
 
 		 633 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25 
 
 		 633 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25 
 
 		 633 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1342  asparagine synthase amidotransferase  27.78 
 
 		 595 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371916  normal  0.923546 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25 
 
 		 633 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5099  asparagine synthase family amidotransferase  28.86 
 
 		 594 aa  88.6  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3398  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.92 
 
 		 594 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108074  normal  0.978255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>