More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0213 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0213  asparagine synthase  100 
 
 
503 aa  1042    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33380  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.41 
 
 
512 aa  151  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.505962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  26.91 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  25.53 
 
 
554 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  24.64 
 
 
554 aa  103  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  26.77 
 
 
498 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  24.9 
 
 
552 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  24.95 
 
 
554 aa  99.8  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  25.25 
 
 
554 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  23.72 
 
 
553 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  25.11 
 
 
554 aa  99  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  25.25 
 
 
554 aa  99  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  24.13 
 
 
557 aa  97.8  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  24.13 
 
 
555 aa  97.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  24.49 
 
 
554 aa  96.7  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  24.49 
 
 
554 aa  96.7  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  24.44 
 
 
554 aa  96.7  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  24.44 
 
 
554 aa  96.7  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  24.49 
 
 
554 aa  96.7  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  24.49 
 
 
554 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  24.07 
 
 
556 aa  95.9  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  24.29 
 
 
554 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  24.58 
 
 
555 aa  93.6  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  24.02 
 
 
556 aa  93.6  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  23.68 
 
 
554 aa  93.2  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  25.69 
 
 
498 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  26.04 
 
 
530 aa  92.8  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  29.03 
 
 
484 aa  93.2  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  23.47 
 
 
554 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.59 
 
 
528 aa  90.9  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  23.04 
 
 
554 aa  89.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  23.43 
 
 
554 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.67 
 
 
510 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  23.17 
 
 
554 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  22.89 
 
 
562 aa  88.2  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  23.09 
 
 
554 aa  88.2  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.67 
 
 
510 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.67 
 
 
510 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.67 
 
 
510 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.67 
 
 
510 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.67 
 
 
510 aa  87  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  24.01 
 
 
554 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.67 
 
 
510 aa  87  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  21.73 
 
 
554 aa  87  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  24.01 
 
 
554 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  24.01 
 
 
554 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  24.01 
 
 
554 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  24.01 
 
 
554 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  24.09 
 
 
571 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  23.17 
 
 
558 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  24 
 
 
554 aa  85.9  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  27.44 
 
 
556 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  26.86 
 
 
482 aa  84.7  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  21.96 
 
 
592 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  31.51 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  23.44 
 
 
554 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  22.82 
 
 
554 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  22.81 
 
 
554 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  22.57 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  22.57 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  22.81 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  23.44 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  22.57 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  22.57 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  23.44 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.57 
 
 
554 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  22.57 
 
 
554 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.06 
 
 
512 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.84 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  26.41 
 
 
554 aa  80.5  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  22.17 
 
 
638 aa  79.7  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  23.17 
 
 
537 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.09 
 
 
591 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25 
 
 
536 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.22 
 
 
632 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  26.96 
 
 
599 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.69 
 
 
514 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  24.91 
 
 
488 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  21.8 
 
 
590 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.26 
 
 
610 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5018  asparagine synthase family amidotransferase  26.35 
 
 
593 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.14 
 
 
633 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1953  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.82 
 
 
611 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.87 
 
 
591 aa  73.9  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.58 
 
 
619 aa  73.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4315  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.31 
 
 
658 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.57 
 
 
600 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.38 
 
 
633 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0733  asparagine synthase  26.92 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00503578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  23.99 
 
 
633 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  23.99 
 
 
633 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  23.99 
 
 
633 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  23.99 
 
 
633 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  23.99 
 
 
633 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  23.99 
 
 
633 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  23.99 
 
 
633 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  23.99 
 
 
633 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.2 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  23.99 
 
 
605 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3062  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.59 
 
 
646 aa  70.5  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>