More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1633 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1750  asparagine synthetase  84.87 
 
 
595 aa  1029    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0957205  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0860  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.3 
 
 
594 aa  635    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0424562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3531  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.13 
 
 
596 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0213452  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3398  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.82 
 
 
594 aa  665    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108074  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  53.98 
 
 
599 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2955  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  83.05 
 
 
589 aa  987    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1633  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  100 
 
 
590 aa  1207    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5353  asparagine synthase family amidotransferase  54.31 
 
 
589 aa  651    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.16 
 
 
600 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1668  asparagine synthase  79.15 
 
 
589 aa  943    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3747  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  98.31 
 
 
590 aa  1190    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1300  asparagine synthase amidotransferase  83.53 
 
 
595 aa  1016    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5018  asparagine synthase family amidotransferase  55.99 
 
 
593 aa  657    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197798  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.55 
 
 
601 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1342  asparagine synthase amidotransferase  83.87 
 
 
595 aa  1016    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371916  normal  0.923546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4100  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  90.68 
 
 
590 aa  1108    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0816  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.18 
 
 
590 aa  669    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816546  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5410  asparagine synthase family amidotransferase  53.98 
 
 
589 aa  647    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360924  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0917  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.3 
 
 
594 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  55.14 
 
 
592 aa  671    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  58.04 
 
 
591 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  57.02 
 
 
590 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2910  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  55.5 
 
 
594 aa  646    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  80 
 
 
589 aa  976    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  56.18 
 
 
590 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.33 
 
 
591 aa  667    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3188  asparagine synthase amidotransferase  56.35 
 
 
589 aa  668    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5099  asparagine synthase family amidotransferase  54.47 
 
 
594 aa  645    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2055  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  57.55 
 
 
601 aa  683    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.33 
 
 
591 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  54.15 
 
 
589 aa  650    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19370  putative asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  79.32 
 
 
589 aa  942    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826487  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2293  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.31 
 
 
593 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00195658  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.41 
 
 
598 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3964  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  84.54 
 
 
595 aa  1026    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414023  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4066  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.72 
 
 
601 aa  697    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.55 
 
 
601 aa  683    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994358  normal  0.105785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.6 
 
 
601 aa  697    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  52.97 
 
 
598 aa  618  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  52.68 
 
 
595 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7206  putative asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  52.65 
 
 
569 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.44 
 
 
590 aa  595  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  51.27 
 
 
588 aa  595  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.71 
 
 
610 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.66 
 
 
593 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2541  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.08 
 
 
621 aa  567  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  0.489677 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  49.25 
 
 
594 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2728  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.41 
 
 
593 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  47.91 
 
 
602 aa  548  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  48.41 
 
 
592 aa  549  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.95 
 
 
646 aa  299  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.65 
 
 
638 aa  293  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.73 
 
 
628 aa  293  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.85 
 
 
625 aa  289  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.49 
 
 
622 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.14 
 
 
633 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.02 
 
 
619 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.93 
 
 
629 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1636  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.78 
 
 
643 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.66 
 
 
610 aa  282  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.61 
 
 
629 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.46 
 
 
623 aa  280  4e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.12 
 
 
629 aa  280  6e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  30.89 
 
 
643 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.09 
 
 
631 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.34 
 
 
630 aa  276  6e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.46 
 
 
637 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.43 
 
 
656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0918  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.43 
 
 
656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.83 
 
 
634 aa  274  3e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1004  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.83 
 
 
656 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.951042  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1158  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.28 
 
 
656 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.433093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0082  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.28 
 
 
656 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.58 
 
 
678 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1535  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.28 
 
 
656 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.06 
 
 
634 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.9 
 
 
678 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.09 
 
 
655 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.45 
 
 
619 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.27 
 
 
632 aa  271  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  30.59 
 
 
637 aa  270  5e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.78 
 
 
629 aa  269  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  30.19 
 
 
633 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  30.19 
 
 
633 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  30.19 
 
 
633 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  30.19 
 
 
633 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  30.19 
 
 
633 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  30.19 
 
 
633 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  30.19 
 
 
633 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4439  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.4 
 
 
634 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.21 
 
 
592 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.41 
 
 
678 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.51 
 
 
627 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  30.03 
 
 
633 aa  266  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.61 
 
 
649 aa  265  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.19 
 
 
633 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.05 
 
 
643 aa  264  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0793  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.19 
 
 
639 aa  264  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.716028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.39 
 
 
633 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.9 
 
 
603 aa  264  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>