181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0834 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0834  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  643    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1295  asparagine synthase  46.65 
 
 
334 aa  262  6e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0774  asparagine synthase  46.84 
 
 
332 aa  257  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.780616  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0855  asparagine synthase  49.04 
 
 
334 aa  256  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.489372  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1015  asparagine synthase  42.72 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  35.2 
 
 
488 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.44 
 
 
530 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1987  asparagine synthase  37.6 
 
 
366 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.87 
 
 
514 aa  122  9e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0733  asparagine synthase  33.9 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00503578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1754  asparagine synthase  34.84 
 
 
387 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0611  asparagine synthase  34.78 
 
 
389 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0500916  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.2 
 
 
513 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.53 
 
 
513 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0465  asparagine synthase  33.2 
 
 
468 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371494  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0732  asparagine synthase  35.12 
 
 
369 aa  109  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.63 
 
 
513 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3539  asparagine synthase  33.48 
 
 
389 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  32 
 
 
503 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  32.84 
 
 
498 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  32.33 
 
 
482 aa  93.2  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  31.72 
 
 
498 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0935  asparagine synthase  27.59 
 
 
339 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.213024 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.03 
 
 
484 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  29.91 
 
 
556 aa  86.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  30.17 
 
 
554 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  27.84 
 
 
554 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  28.24 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  28.24 
 
 
554 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  29.31 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  27.56 
 
 
562 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  30.9 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  29.31 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  29.31 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.31 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  29.31 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  29.31 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  29.31 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  28.08 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  29.31 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  29.31 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  28.08 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  26.69 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  29.31 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  29.31 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  29.31 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  29.31 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  28.08 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  27.72 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  29.31 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  28.85 
 
 
554 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  28.63 
 
 
557 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  28.45 
 
 
554 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  29.41 
 
 
552 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  29.64 
 
 
554 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  27.21 
 
 
555 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  26.46 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  28.35 
 
 
554 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  28.79 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  28.63 
 
 
554 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  28.85 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  28.79 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  28.85 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1466  asparagine synthase  26.86 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  29.25 
 
 
554 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  29.13 
 
 
554 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  28.76 
 
 
553 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  26.05 
 
 
558 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  28.33 
 
 
556 aa  79.7  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  28.85 
 
 
554 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  28.85 
 
 
554 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  28.02 
 
 
555 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  28.33 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  29.18 
 
 
554 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  27.82 
 
 
596 aa  75.9  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  24.9 
 
 
573 aa  73.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.56 
 
 
536 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  28.88 
 
 
537 aa  68.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  26.52 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.29 
 
 
554 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.21 
 
 
512 aa  66.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  26.94 
 
 
543 aa  66.6  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  24.76 
 
 
571 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0213  asparagine synthase  26.67 
 
 
503 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6993  asparagine synthase  32.16 
 
 
470 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  26.07 
 
 
638 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.2 
 
 
528 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.64 
 
 
510 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.64 
 
 
510 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.64 
 
 
510 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.64 
 
 
510 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.64 
 
 
510 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.64 
 
 
510 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.64 
 
 
510 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  28.08 
 
 
563 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  28.69 
 
 
537 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  28.08 
 
 
563 aa  59.7  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2921  asparagine synthase family protein  25.4 
 
 
499 aa  59.7  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.458413  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  26.55 
 
 
592 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  28.57 
 
 
564 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>