257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1466 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1466  asparagine synthase  100 
 
 
251 aa  519  1e-146  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0465  asparagine synthase  27.6 
 
 
468 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  28.63 
 
 
488 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.13 
 
 
514 aa  94  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.64 
 
 
530 aa  90.5  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.28 
 
 
536 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1015  asparagine synthase  31.15 
 
 
329 aa  89.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.74 
 
 
513 aa  89.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1754  asparagine synthase  25.59 
 
 
387 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.64 
 
 
513 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.87 
 
 
513 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0834  hypothetical protein  26.86 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.49 
 
 
554 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3539  asparagine synthase  25.54 
 
 
389 aa  75.1  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0733  asparagine synthase  28.85 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00503578  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0732  asparagine synthase  27.2 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  26.32 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  26.25 
 
 
492 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1295  asparagine synthase  23.18 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  27.23 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0855  asparagine synthase  25.56 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.489372  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  26.27 
 
 
638 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0774  asparagine synthase  23.45 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.780616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  24.68 
 
 
503 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0611  asparagine synthase  23.18 
 
 
389 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0500916  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.67 
 
 
605 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.08 
 
 
633 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.37 
 
 
633 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1987  asparagine synthase  26.02 
 
 
366 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.67 
 
 
633 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  28.67 
 
 
633 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  28.67 
 
 
633 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.67 
 
 
633 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.77 
 
 
633 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.67 
 
 
633 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.67 
 
 
633 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.67 
 
 
633 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  23.95 
 
 
562 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0935  asparagine synthase  23.5 
 
 
339 aa  60.1  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.213024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3348  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.76 
 
 
643 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  25.21 
 
 
554 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  23.11 
 
 
558 aa  59.3  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0213  asparagine synthase  23.58 
 
 
503 aa  59.3  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.67 
 
 
635 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  25.58 
 
 
554 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.46 
 
 
512 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1536  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.97 
 
 
654 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.55086  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  25.44 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.44 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.77 
 
 
632 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  25.44 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  25.44 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  25.44 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  24.3 
 
 
554 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  23.51 
 
 
554 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  23.11 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  25.44 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  25.44 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1366  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.11 
 
 
642 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  22.71 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  25.44 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  25.44 
 
 
554 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.22 
 
 
619 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.26 
 
 
621 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  23.51 
 
 
554 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  24.12 
 
 
554 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  22.31 
 
 
554 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  24.56 
 
 
554 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  24.03 
 
 
554 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  22.31 
 
 
554 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  22.31 
 
 
554 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  24.12 
 
 
554 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  24.12 
 
 
554 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  29.33 
 
 
630 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  25.69 
 
 
543 aa  55.8  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  23.61 
 
 
554 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  23.61 
 
 
554 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  23.51 
 
 
554 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1537  asparagine synthase  22.97 
 
 
274 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0538589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  22.92 
 
 
553 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  23.51 
 
 
554 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5099  asparagine synthase family amidotransferase  28.77 
 
 
594 aa  55.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5318  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.87 
 
 
657 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0596  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.36 
 
 
630 aa  55.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  23.51 
 
 
555 aa  55.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  24.57 
 
 
554 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  24.57 
 
 
554 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  22.41 
 
 
498 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  24.57 
 
 
554 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  24.57 
 
 
554 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  24.57 
 
 
554 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.72 
 
 
632 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  22.31 
 
 
554 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  21.34 
 
 
498 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  24.79 
 
 
484 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.17 
 
 
610 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  23.11 
 
 
554 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  25.22 
 
 
554 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3256  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.75 
 
 
634 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00445489  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1053  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.04 
 
 
649 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000122454  hitchhiker  0.00273706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>