More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2921 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2921  asparagine synthase family protein  100 
 
 		 499 aa  1034    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.458413  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  28.25 
 
 		 554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  29.18 
 
 		 554 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  29.18 
 
 		 554 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  29.18 
 
 		 554 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  28.48 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  29.38 
 
 		 488 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  29.22 
 
 		 554 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.34 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.34 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.34 
 
 		 510 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.34 
 
 		 510 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  27.36 
 
 		 503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.09 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.09 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.8 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.09 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  27.66 
 
 		 554 aa  120  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  28.01 
 
 		 553 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  26.7 
 
 		 554 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  26.91 
 
 		 554 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  25.93 
 
 		 562 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  26.33 
 
 		 558 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  28.14 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  28.14 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  28.23 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  27.71 
 
 		 554 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  26.91 
 
 		 556 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  27.02 
 
 		 552 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  27.25 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  27.29 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  26.18 
 
 		 555 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  27.41 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  26.45 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  26.45 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  26.45 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  25.65 
 
 		 554 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  27.07 
 
 		 498 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  27.27 
 
 		 554 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  27.23 
 
 		 554 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.32 
 
 		 536 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  27.51 
 
 		 554 aa  114  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  27.35 
 
 		 563 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  27.27 
 
 		 554 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  26.87 
 
 		 556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  27.31 
 
 		 554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  27.29 
 
 		 556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  27.05 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  27.05 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  27.21 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.21 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  27.21 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  27.21 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  26.71 
 
 		 557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  27.21 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  27.21 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  26.82 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  27.51 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  26.54 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  27.31 
 
 		 554 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  26.98 
 
 		 554 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6993  asparagine synthase  25.38 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  27.84 
 
 		 564 aa  110  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  27.21 
 
 		 554 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.16 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  27.01 
 
 		 555 aa  108  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  27.52 
 
 		 554 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  25.79 
 
 		 638 aa  107  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  26.28 
 
 		 554 aa  106  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.54 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  26.04 
 
 		 596 aa  103  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  26.3 
 
 		 563 aa  103  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  26.22 
 
 		 482 aa  103  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  26.45 
 
 		 543 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.05 
 
 		 530 aa  100  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.75 
 
 		 513 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  22.96 
 
 		 530 aa  98.2  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.23 
 
 		 514 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.55 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  25.06 
 
 		 573 aa  95.5  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  28.02 
 
 		 537 aa  94  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  24.91 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  26.2 
 
 		 592 aa  93.6  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3175  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  25.7 
 
 		 643 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  24.46 
 
 		 571 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.95 
 
 		 513 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0186  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.94 
 
 		 583 aa  90.5  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0185  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.63 
 
 		 670 aa  86.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  27.17 
 
 		 537 aa  86.7  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.86 
 
 		 623 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.49 
 
 		 591 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.58 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0353  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.76 
 
 		 611 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5018  asparagine synthase family amidotransferase  24.36 
 
 		 593 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197798  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.12 
 
 		 596 aa  80.5  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.93 
 
 		 639 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1617  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.73 
 
 		 583 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.48 
 
 		 606 aa  79  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04798  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.63 
 
 		 646 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  21.26 
 
 		 589 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>