More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3175 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0241  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.62 
 
 
654 aa  650    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.148011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3175  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  100 
 
 
643 aa  1330    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0668  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  52.23 
 
 
651 aa  676    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.223123  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1275  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  50.08 
 
 
650 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.157776  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5373  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  53.16 
 
 
676 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2478  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  52.82 
 
 
660 aa  681    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.669542  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4740  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.15 
 
 
655 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  50.62 
 
 
655 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2172  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  48.28 
 
 
665 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.71793  hitchhiker  0.0000206838 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.61 
 
 
655 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.76 
 
 
656 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3988  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  52.82 
 
 
656 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  50.61 
 
 
656 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4217  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.15 
 
 
655 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.61 
 
 
656 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.15 
 
 
637 aa  632  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  49.15 
 
 
637 aa  632  1e-180  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.77 
 
 
656 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0918  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.77 
 
 
656 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1004  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.77 
 
 
656 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.951042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2339  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.3 
 
 
639 aa  620  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.795917  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1158  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.62 
 
 
656 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.433093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0082  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.62 
 
 
656 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5624  putative asparagine synthetase  47.94 
 
 
656 aa  616  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622425  normal  0.579265 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1535  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.62 
 
 
656 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1749  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.31 
 
 
656 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3228  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  46.33 
 
 
653 aa  600  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1548  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  46.01 
 
 
647 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545574  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1636  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  44.46 
 
 
643 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2615  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  44.68 
 
 
637 aa  548  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.665641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04798  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  43.1 
 
 
646 aa  548  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2639  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  43.66 
 
 
647 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.160881 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0146  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  43.47 
 
 
652 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  41.96 
 
 
658 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0474  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.48 
 
 
633 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.35 
 
 
623 aa  438  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.47 
 
 
634 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.62 
 
 
632 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.25 
 
 
639 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  38.17 
 
 
643 aa  412  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.44 
 
 
633 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1324  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  37 
 
 
622 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.174178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.44 
 
 
629 aa  405  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.48 
 
 
635 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.13 
 
 
629 aa  399  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.83 
 
 
625 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.12 
 
 
647 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.2 
 
 
643 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.08 
 
 
637 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.56 
 
 
641 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.74 
 
 
646 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3272  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  35.18 
 
 
642 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.93 
 
 
638 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.11 
 
 
641 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.03 
 
 
629 aa  363  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3607  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.64 
 
 
615 aa  363  7.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.75 
 
 
631 aa  362  9e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.02 
 
 
628 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0358  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.14 
 
 
697 aa  360  4e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.395531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.34 
 
 
622 aa  360  5e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.88 
 
 
631 aa  360  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.55 
 
 
629 aa  354  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.85 
 
 
633 aa  352  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.57 
 
 
619 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1611  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.08 
 
 
600 aa  340  5.9999999999999996e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0596  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.33 
 
 
630 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.28 
 
 
635 aa  334  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.15 
 
 
632 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.46 
 
 
625 aa  322  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13023  probable asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.8 
 
 
597 aa  322  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4439  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.74 
 
 
634 aa  319  9e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.13 
 
 
633 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.05 
 
 
633 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0793  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.49 
 
 
639 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.716028 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.05 
 
 
633 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.9 
 
 
633 aa  317  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.9 
 
 
633 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  31.9 
 
 
633 aa  317  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  31.9 
 
 
633 aa  317  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.9 
 
 
633 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.9 
 
 
633 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.9 
 
 
633 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.64 
 
 
627 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.26 
 
 
634 aa  316  8e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0497  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.29 
 
 
630 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0431896  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1353  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.86 
 
 
632 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.1901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.9 
 
 
632 aa  312  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.1 
 
 
605 aa  310  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  32.79 
 
 
630 aa  304  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3049  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.76 
 
 
643 aa  300  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.524302  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1615  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.25 
 
 
620 aa  299  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2533  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.91 
 
 
625 aa  297  4e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3554  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.23 
 
 
640 aa  296  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1366  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.64 
 
 
642 aa  296  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.29 
 
 
610 aa  291  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.61 
 
 
649 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3310  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.17 
 
 
655 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959151  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3361  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.17 
 
 
655 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3299  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.17 
 
 
655 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0135  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.71 
 
 
649 aa  289  1e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000081713  normal  0.012193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>