44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3538 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  100 
 
 		 205 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  39.51 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  39.02 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  38.61 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  39.23 
 
 		 292 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  37.37 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  37.43 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  36.82 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  35.71 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  36.08 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  40.45 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  34.27 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  37.75 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  36.27 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  38.31 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1117  hypothetical protein  36.55 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  32.7 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  38.27 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  32.09 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  40.95 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  35.91 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  51.14 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1305  hypothetical protein  27.61 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  50.55 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  41.9 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  40.71 
 
 		 228 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  22.97 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  24.64 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  30.63 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  23.94 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  24.53 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  23.92 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  31.4 
 
 		 247 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  23.92 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  39.36 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  39.36 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3418  hypothetical protein  26.75 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.987927  normal  0.302844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  27.88 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  39.36 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  42.16 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  36.04 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0590  protein of unknown function DUF121  35.85 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.304416  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  33.86 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  34.03 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>