37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4222 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  74.3 
 
 
213 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  66.98 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  67.48 
 
 
218 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  67.48 
 
 
218 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  68.14 
 
 
218 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  48.08 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  41.88 
 
 
200 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  42.31 
 
 
236 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  41.95 
 
 
219 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  43.69 
 
 
204 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  43.48 
 
 
230 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  47.37 
 
 
224 aa  101  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  41.29 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  38.35 
 
 
247 aa  96.3  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  46 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  38.53 
 
 
292 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  38.49 
 
 
284 aa  89.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  39.71 
 
 
214 aa  88.2  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  39.47 
 
 
260 aa  87.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  37.19 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  35.03 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  47.15 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  43.22 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  37.88 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  43.07 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  46.55 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  37.32 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  36.27 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  32.12 
 
 
210 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  24.23 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  31.19 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4046  hypothetical protein  28.42 
 
 
210 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3010  protein of unknown function DUF121  32.14 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  32.99 
 
 
205 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  35.14 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  23.16 
 
 
224 aa  42  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>