35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1139 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  437  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  63.55 
 
 		 210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  35.03 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4046  hypothetical protein  31.61 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  29.17 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  34.9 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1837  hypothetical protein  27.7 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  34.52 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  25.89 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  27.62 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4254  protein of unknown function DUF121  28.57 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  26.83 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  26.87 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1358  hypothetical protein  27.51 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00021532  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  26 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  26.02 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2198  hypothetical protein  29.72 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0590  protein of unknown function DUF121  34.52 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.304416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3418  hypothetical protein  25.98 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.987927  normal  0.302844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  34.07 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  33.16 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0159  hypothetical protein  29.22 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0429  protein of unknown function DUF121  26.88 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0656298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  31.75 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  31.16 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1305  hypothetical protein  25.13 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4422  hypothetical protein  31.36 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.816566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  30.1 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  32.08 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  30.61 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1254  hypothetical protein  26.34 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00194162  normal  0.192992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3010  protein of unknown function DUF121  36.46 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  30.48 
 
 		 247 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1117  hypothetical protein  29.59 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0413  hypothetical protein  31.94 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>