28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4254 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4254  protein of unknown function DUF121  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661171  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4046  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1117  hypothetical protein  37.82 
 
 
216 aa  84.7  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  30.62 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  30.81 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  30.69 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  28.49 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  21.39 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  20.86 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  22.28 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  20.86 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1837  hypothetical protein  26.07 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  26.63 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  31.94 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  20.98 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0159  hypothetical protein  28.12 
 
 
221 aa  48.5  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  26.02 
 
 
205 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  34.47 
 
 
214 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1305  hypothetical protein  23.94 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  29.23 
 
 
236 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  21.2 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2198  hypothetical protein  28.5 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  22.22 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  28.49 
 
 
422 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4422  hypothetical protein  27.75 
 
 
199 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.816566  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  28.99 
 
 
210 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  29.69 
 
 
205 aa  42  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1254  hypothetical protein  26.13 
 
 
217 aa  42  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00194162  normal  0.192992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>