21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4046 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4046  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4254  protein of unknown function DUF121  33.33 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  30.26 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  31.38 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  29.61 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1117  hypothetical protein  32.84 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  30.32 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  26.9 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  23.76 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  25.13 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  28.42 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4422  hypothetical protein  27.6 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.816566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  29.9 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1837  hypothetical protein  25.77 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1893  protein of unknown function DUF121  27.23 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.739465  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  29.19 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1305  hypothetical protein  24.37 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2198  hypothetical protein  28.64 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  25.65 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  26.83 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>