36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3980 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  63.55 
 
 		 222 aa  250  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  36.14 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  35.03 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3418  hypothetical protein  30.2 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.987927  normal  0.302844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  28.93 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4046  hypothetical protein  31.38 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  29.17 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  29.03 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  28.49 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  28.65 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1837  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1305  hypothetical protein  26.57 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0429  protein of unknown function DUF121  30.05 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0656298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  27.94 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0159  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4254  protein of unknown function DUF121  29.74 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  31.55 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2198  hypothetical protein  30.85 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  26.9 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1358  hypothetical protein  27.54 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00021532  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  32.09 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4422  hypothetical protein  32.62 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.816566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  32.12 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  34.76 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  33.18 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0590  protein of unknown function DUF121  28.75 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.304416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  32.32 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  33.52 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1117  hypothetical protein  31.09 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3010  protein of unknown function DUF121  35.57 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  35.61 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  30.37 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1254  hypothetical protein  23.22 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00194162  normal  0.192992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  28.5 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>