24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3418 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3418  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.987927  normal  0.302844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1305  hypothetical protein  52.4 
 
 		 220 aa  237  8e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2198  hypothetical protein  45.59 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1358  hypothetical protein  45.54 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00021532  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1837  hypothetical protein  44.23 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0429  protein of unknown function DUF121  42.72 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0656298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1254  hypothetical protein  38.42 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00194162  normal  0.192992 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1414  phospholactate guanylyltransferase  37.75 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.398259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2631  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  38.26 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1302  phospholactate guanylyltransferase  36.23 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.726786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1893  protein of unknown function DUF121  37.16 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.739465  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0640  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  37.44 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0159  hypothetical protein  36.84 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  31.67 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  31.22 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  31.36 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  31.39 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  30.2 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  33.66 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  29.57 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  31.61 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  29.63 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  28.8 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  26.75 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>