34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1561 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  95.05 
 
 
222 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  94.14 
 
 
222 aa  424  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  81.98 
 
 
224 aa  378  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  61.26 
 
 
224 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1837  hypothetical protein  30.88 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1358  hypothetical protein  32.34 
 
 
212 aa  90.1  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00021532  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3418  hypothetical protein  31.36 
 
 
208 aa  89  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.987927  normal  0.302844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0429  protein of unknown function DUF121  30.14 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0656298  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0159  hypothetical protein  27.65 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2631  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  28.32 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2198  hypothetical protein  31.34 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  29.03 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1305  hypothetical protein  32.06 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1254  hypothetical protein  28.44 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00194162  normal  0.192992 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  30 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1893  protein of unknown function DUF121  23.36 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.739465  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  26.46 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  28.24 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1302  phospholactate guanylyltransferase  24.64 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.726786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1414  phospholactate guanylyltransferase  23.83 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.398259  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  27.59 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0640  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  25.34 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  24.48 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  25.13 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1117  hypothetical protein  24.21 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  24.63 
 
 
200 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  24.41 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  24.53 
 
 
205 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4254  protein of unknown function DUF121  26.37 
 
 
213 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661171  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4422  hypothetical protein  27.33 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.816566  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  24.23 
 
 
247 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  21.84 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  22.22 
 
 
202 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>