37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0188 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  100 
 
 		 230 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  63.16 
 
 		 200 aa  204  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  55.77 
 
 		 222 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  51.43 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  57.71 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  63.5 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  52.91 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  44.98 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  48.26 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  43.78 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  44.06 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  48.28 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  43.48 
 
 		 214 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  42.15 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  50.25 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  49.5 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  38.43 
 
 		 284 aa  95.9  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  37.66 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  39 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  44.28 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  37.16 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  37.43 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  43.84 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  43.84 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  42.92 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  25.98 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  25.13 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  24.51 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  31.43 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  34.6 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  32.87 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  27.42 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  34.27 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  24.54 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4254  protein of unknown function DUF121  30.89 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  28.5 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1358  hypothetical protein  29.59 
 
 		 212 aa  42  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00021532  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>