25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4422 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4422  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.816566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  31.96 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  35.08 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  34 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  33.86 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  33.16 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  25.13 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3010  protein of unknown function DUF121  33.33 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  26.6 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  30.96 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  31.36 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  27.98 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0413  hypothetical protein  28.65 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4046  hypothetical protein  27.6 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  27.91 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1358  hypothetical protein  28.72 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00021532  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  34.32 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  28.49 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  26.74 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2198  hypothetical protein  27.88 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  35.54 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1117  hypothetical protein  32.77 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0590  protein of unknown function DUF121  29.09 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.304416  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1893  protein of unknown function DUF121  31.47 
 
 		 217 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.739465  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0159  hypothetical protein  27.05 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>