21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0413 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0413  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  34.07 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  32.31 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4422  hypothetical protein  30.73 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.816566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  32.14 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  25.91 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3010  protein of unknown function DUF121  38.58 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  33.7 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  33.16 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4254  protein of unknown function DUF121  28.42 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0159  hypothetical protein  29.38 
 
 		 221 aa  51.6  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0590  protein of unknown function DUF121  30.38 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.304416  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1117  hypothetical protein  32.11 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  31.69 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1358  hypothetical protein  25.28 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00021532  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  22.88 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  29.29 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 458 aa  41.2  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>