21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0625 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  431  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  26.94 
 
 
223 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  29.81 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  28.95 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4422  hypothetical protein  25.13 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.816566  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  26.9 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  27.37 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  26.36 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1117  hypothetical protein  25 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4046  hypothetical protein  26.9 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  24.74 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  26 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  22.77 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  23.94 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  23.61 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  22.05 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4254  protein of unknown function DUF121  21.39 
 
 
213 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661171  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  22.55 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1837  hypothetical protein  25.13 
 
 
215 aa  42  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>