33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0865 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  44.06 
 
 
230 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  40.62 
 
 
292 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  46.15 
 
 
215 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  43.08 
 
 
200 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  39.51 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  39.51 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  39.51 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  37.91 
 
 
260 aa  89.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  37.44 
 
 
236 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  37.33 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  37.88 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  41.62 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  34.74 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  36.06 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  34.64 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  46.36 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  44.12 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  37.25 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  42.22 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  42.22 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  42.22 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  33.33 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  38.71 
 
 
214 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  45.79 
 
 
265 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  44.55 
 
 
259 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  40.54 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  34.08 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  23.61 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  39.2 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  18.93 
 
 
224 aa  47  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  29.19 
 
 
230 aa  45.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  21.43 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>