33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8045 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  457  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  51.43 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  51.22 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  48.54 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  48.79 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  52.63 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  47.03 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  41.88 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  44.27 
 
 		 200 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  42.31 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  50.49 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  45.19 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  46.57 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  39.6 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  38.93 
 
 		 259 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  37.11 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  41.71 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  37.44 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  43 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  43 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  42.51 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  34.35 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  36.82 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  41.75 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  43.15 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  38.57 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  30.61 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  33.18 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  32.87 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  22.77 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  31.12 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  32.09 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  34.3 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>