36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  40.66 
 
 		 219 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  41.04 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  38.71 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  43.15 
 
 		 215 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  36.47 
 
 		 236 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  38.27 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  38.49 
 
 		 214 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  39.11 
 
 		 210 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  36.19 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  42.17 
 
 		 214 aa  92.8  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  37.76 
 
 		 213 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  37.72 
 
 		 200 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  42.8 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  40.15 
 
 		 228 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  36.55 
 
 		 205 aa  86.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  39.36 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  36.21 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  34.45 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  37.87 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  38.31 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  40.64 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  35.32 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  35.32 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  35.54 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  35.32 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  33.2 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3010  protein of unknown function DUF121  32.63 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  19.67 
 
 		 224 aa  49.3  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  19.26 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  37.83 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  21.01 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  34.92 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  21.25 
 
 		 222 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  21.25 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  31.06 
 
 		 205 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>