39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3631 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  394  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  43.28 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  39.71 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  44.78 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  48.48 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  46.26 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  39.91 
 
 		 292 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  41.75 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  47.72 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  41.37 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  38.76 
 
 		 222 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  36.89 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  43.5 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  38.92 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  47.79 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  38.27 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  37.39 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  33.66 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  38.42 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  45.23 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  39.84 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  40.98 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  47.52 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  47.12 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  47.12 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  47.12 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  33.15 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  36.32 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  35.16 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  32.82 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  36.98 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  23.53 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  37.5 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  22.54 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  22.12 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3010  protein of unknown function DUF121  35.71 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1117  hypothetical protein  36.1 
 
 		 216 aa  42  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4046  hypothetical protein  28.71 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>