33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2843 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  100 
 
 
224 aa  414  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  46.89 
 
 
214 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  47.37 
 
 
213 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  45.5 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  45.02 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  46.89 
 
 
218 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  46.89 
 
 
218 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  46.41 
 
 
218 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  40.87 
 
 
204 aa  91.7  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  39.52 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  51.75 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  43.9 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  37.95 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  40.41 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  40.93 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  36.92 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  47.06 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  35.68 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  36.53 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  41.14 
 
 
292 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  41.79 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  38.42 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  42 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  44.51 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  36.24 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  42.16 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  43.85 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  34.15 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  35.55 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  36.71 
 
 
211 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  38.39 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  37.31 
 
 
205 aa  42  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  32.73 
 
 
455 aa  41.6  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>