35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1264 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  82.71 
 
 		 214 aa  274  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  51.96 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  55.07 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  50.25 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  50.5 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  46.19 
 
 		 292 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  45.92 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  46 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  47.64 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  48 
 
 		 204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  43.5 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  49.75 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  48.04 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  47.55 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  47.55 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  42.8 
 
 		 284 aa  95.9  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  42.21 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  46.77 
 
 		 211 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  47.55 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  37.24 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  44.12 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  57.38 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  37.07 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  39.9 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  37.04 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  44.62 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  26.88 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  26.46 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  25.93 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  26.46 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  32.29 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  26.62 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>