36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3458 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  100 
 
 		 228 aa  427  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  60.78 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  63.77 
 
 		 219 aa  222  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  63.5 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  57.98 
 
 		 200 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  53.11 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  59.42 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  46.15 
 
 		 292 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  53.2 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  50.73 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  44.49 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  44.12 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  43 
 
 		 213 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  41.2 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  42.57 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  51.96 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  37.92 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  43.22 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  40.8 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  51.13 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  47.78 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  47.78 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  35.58 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  45.32 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  37.2 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  38.07 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  36.22 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  33.69 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  24.74 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  41.23 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  22.17 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3010  protein of unknown function DUF121  34.48 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  35.47 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4422  hypothetical protein  33.68 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.816566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  34.52 
 
 		 202 aa  41.6  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>