33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0629 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  63.16 
 
 
230 aa  204  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  54.69 
 
 
222 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  54.12 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  44.27 
 
 
236 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  57.98 
 
 
228 aa  120  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  50.29 
 
 
215 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  44.86 
 
 
292 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  41.88 
 
 
214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  40.84 
 
 
213 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  43.08 
 
 
210 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  44.79 
 
 
214 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  49.59 
 
 
218 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  49.59 
 
 
218 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  49.59 
 
 
218 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  41.36 
 
 
214 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  54.14 
 
 
259 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  38.64 
 
 
260 aa  87  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  44.85 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  37.37 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  37.05 
 
 
265 aa  82  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  44.37 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  44.03 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  47.64 
 
 
226 aa  77.8  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  33.33 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  38.42 
 
 
214 aa  61.2  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  24.63 
 
 
224 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  35.21 
 
 
247 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  24.63 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  25.12 
 
 
222 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  24.63 
 
 
222 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  40.41 
 
 
224 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  32.39 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>