34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1116 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  443  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  95.05 
 
 
222 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  94.14 
 
 
222 aa  424  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  82.88 
 
 
224 aa  380  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  60.36 
 
 
224 aa  276  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1837  hypothetical protein  30.88 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3418  hypothetical protein  31.67 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.987927  normal  0.302844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0429  protein of unknown function DUF121  31.19 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0656298  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1358  hypothetical protein  32.37 
 
 
212 aa  88.6  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00021532  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0159  hypothetical protein  27.23 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2198  hypothetical protein  32.57 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2631  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  27.19 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  28.65 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1254  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00194162  normal  0.192992 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  28.95 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1305  hypothetical protein  28.44 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  29.41 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  26.46 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1893  protein of unknown function DUF121  22.43 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.739465  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0640  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  26.24 
 
 
231 aa  62  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  27.59 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1302  phospholactate guanylyltransferase  23.19 
 
 
202 aa  58.9  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.726786  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  24.74 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1414  phospholactate guanylyltransferase  21.76 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.398259  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  25.12 
 
 
200 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1117  hypothetical protein  23.68 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  25.58 
 
 
219 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  23.92 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4254  protein of unknown function DUF121  25.27 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661171  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  23.91 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4422  hypothetical protein  27.33 
 
 
199 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.816566  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  23.35 
 
 
247 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  22.22 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  21.84 
 
 
204 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>