20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1117 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1117  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4046  hypothetical protein  33.5 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4254  protein of unknown function DUF121  37.82 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  33.68 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  36.55 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0625  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  25.65 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  27.72 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  25.13 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  24.21 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  31.61 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  23.56 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  33.85 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1358  hypothetical protein  28.71 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00021532  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  31.61 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1837  hypothetical protein  26.5 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  21.83 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  32.37 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0159  hypothetical protein  32.87 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  35.27 
 
 		 214 aa  42  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>