20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1893 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1893  protein of unknown function DUF121  100 
 
 		 217 aa  417  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.739465  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2631  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  56.9 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1414  phospholactate guanylyltransferase  60.19 
 
 		 203 aa  218  7e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.398259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1302  phospholactate guanylyltransferase  56.48 
 
 		 202 aa  194  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.726786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0640  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  55.46 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1837  hypothetical protein  41.2 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.766585  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2198  hypothetical protein  43.46 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1254  hypothetical protein  42.01 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00194162  normal  0.192992 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1358  hypothetical protein  38.6 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00021532  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0429  protein of unknown function DUF121  40.93 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0656298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3418  hypothetical protein  37.16 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.987927  normal  0.302844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1305  hypothetical protein  34.86 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0159  hypothetical protein  32.56 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0658  hypothetical protein  25.77 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000185667  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1561  hypothetical protein  23.36 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0835  hypothetical protein  22.43 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.969828  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  26.48 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1116  hypothetical protein  22.43 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  31.25 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4046  hypothetical protein  27.23 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>