37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1926 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  417  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  417  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  99.08 
 
 
218 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  71.36 
 
 
213 aa  264  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  67.96 
 
 
214 aa  263  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  66.18 
 
 
214 aa  227  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  50 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  46.6 
 
 
200 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  42.58 
 
 
222 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  43.48 
 
 
236 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  45.91 
 
 
230 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  46.04 
 
 
219 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  44.61 
 
 
204 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  42.31 
 
 
292 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  47.85 
 
 
224 aa  95.1  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  54.62 
 
 
265 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  47.06 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  38.94 
 
 
247 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  36.6 
 
 
284 aa  79  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  35.68 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  38.5 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  45.54 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  48.46 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  48.04 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  40.19 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  42.94 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  34.8 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3980  hypothetical protein  35.08 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0462396 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1863  protein of unknown function DUF121  26.02 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0666  protein of unknown function DUF121  30.61 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000146707  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  37.23 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  35.94 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1139  hypothetical protein  31.68 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4046  hypothetical protein  29.08 
 
 
210 aa  45.1  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3010  protein of unknown function DUF121  35.05 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0959  hypothetical protein  31.96 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1122  hypothetical protein  22.82 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>