30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09110 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  55.48 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  54.62 
 
 		 218 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  54.62 
 
 		 218 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  54.62 
 
 		 218 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  37.55 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  37.2 
 
 		 200 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  35.38 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  36.22 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  53.33 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  49.58 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  48.12 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  34.75 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  37.31 
 
 		 215 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  34.1 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  33.21 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  34.75 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  35.56 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  53.85 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  50.47 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  47.45 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  38.74 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  51.14 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  47.66 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0815  hypothetical protein  40.68 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.252182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  32.27 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  55.91 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  35.04 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4150  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  36.99 
 
 		 223 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115141  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3010  protein of unknown function DUF121  28.51 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>