27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1121 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1121  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3616  hypothetical protein  55.14 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0188  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  43.39 
 
 		 230 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8012  hypothetical protein  41.42 
 
 		 222 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8045  hypothetical protein  39.75 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4049  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  44.35 
 
 		 215 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00779937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0629  hypothetical protein  42.98 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2795  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329228  normal  0.0592369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09110  hypothetical protein  40.94 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1155  hypothetical protein  42.21 
 
 		 214 aa  89.4  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12998  hypothetical protein  52.78 
 
 		 214 aa  89  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.769383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24100  hypothetical protein  37.05 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.709726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6000  hypothetical protein  48.84 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1961  hypothetical protein  37.5 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1926  hypothetical protein  48.46 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1972  hypothetical protein  48.46 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1906  hypothetical protein  48.46 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2140  hypothetical protein  46.88 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4222  hypothetical protein  46.55 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3538  protein of unknown function DUF121  39.73 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000427538  decreased coverage  0.00109998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3458  protein of unknown function DUF121  45.53 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3631  hypothetical protein  39.68 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1264  hypothetical protein  44.26 
 
 		 226 aa  72  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3295  hypothetical protein  35.39 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0865  hypothetical protein  35.27 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3210  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  41.67 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2843  2-phospho-L-lactate guanylyltransferase CofC  43.12 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>