More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2105 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  44.61 
 
 		 970 aa  712    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  45.1 
 
 		 958 aa  735    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1106  preprotein translocase subunit SecA  45.07 
 
 		 935 aa  743    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3269  preprotein translocase subunit SecA  40.21 
 
 		 930 aa  679    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659799  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 		 907 aa  682    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1220  preprotein translocase subunit SecA  43.26 
 
 		 942 aa  706    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0984174  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0390  preprotein translocase subunit SecA  43.97 
 
 		 953 aa  716    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3658  preprotein translocase subunit SecA  43.71 
 
 		 932 aa  763    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  44.4 
 
 		 932 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0123  preprotein translocase subunit SecA  44.9 
 
 		 937 aa  751    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0081  preprotein translocase subunit SecA  45.51 
 
 		 934 aa  750    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  43.78 
 
 		 936 aa  718    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0289  preprotein translocase subunit SecA  44.17 
 
 		 948 aa  756    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  44 
 
 		 930 aa  729    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7588  preprotein translocase subunit SecA  45.27 
 
 		 950 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.334261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  43.95 
 
 		 949 aa  718    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0530  preprotein translocase subunit SecA  43.48 
 
 		 946 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0511  preprotein translocase subunit SecA  43.42 
 
 		 946 aa  712    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  43.43 
 
 		 956 aa  689    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0526  preprotein translocase subunit SecA  42.8 
 
 		 947 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723301  normal  0.383723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  43.88 
 
 		 963 aa  706    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  43.84 
 
 		 936 aa  716    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0299  preprotein translocase subunit SecA  42.46 
 
 		 946 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0708  preprotein translocase, SecA subunit  45.87 
 
 		 958 aa  739    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  43.54 
 
 		 951 aa  711    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  44.19 
 
 		 932 aa  733    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  43.74 
 
 		 920 aa  709    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1077  preprotein translocase subunit SecA  45.18 
 
 		 935 aa  744    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0512  preprotein translocase, SecA subunit  43.91 
 
 		 931 aa  719    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  43.21 
 
 		 955 aa  732    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  44.53 
 
 		 931 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0287  preprotein translocase subunit SecA  45.48 
 
 		 964 aa  742    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.196625  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1756  preprotein translocase, SecA subunit  43.71 
 
 		 970 aa  708    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  44.53 
 
 		 931 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  44.1 
 
 		 936 aa  729    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  43.61 
 
 		 970 aa  707    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  45.05 
 
 		 908 aa  739    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0922  preprotein translocase subunit SecA  41.49 
 
 		 921 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.666696  normal  0.803255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  41.87 
 
 		 906 aa  671    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2105  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 1007 aa  2052    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.877046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1643  preprotein translocase, SecA subunit  78.53 
 
 		 998 aa  1605    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1058  preprotein translocase subunit SecA  64.1 
 
 		 869 aa  605  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.981267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  62.23 
 
 		 896 aa  575  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  61.59 
 
 		 888 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  58.37 
 
 		 873 aa  555  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  60.22 
 
 		 834 aa  555  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  58.57 
 
 		 899 aa  548  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  56.91 
 
 		 958 aa  548  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  60.09 
 
 		 872 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  56.5 
 
 		 957 aa  544  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  57.92 
 
 		 899 aa  545  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  57.54 
 
 		 897 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  58.5 
 
 		 864 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  55.82 
 
 		 845 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  58.39 
 
 		 894 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  56.35 
 
 		 896 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  58.96 
 
 		 848 aa  539  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  58.28 
 
 		 903 aa  535  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  58.1 
 
 		 830 aa  535  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  53.83 
 
 		 910 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  56.59 
 
 		 1009 aa  531  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  56.96 
 
 		 897 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  56.62 
 
 		 912 aa  527  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  56.39 
 
 		 954 aa  529  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  57.51 
 
 		 933 aa  529  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  55.8 
 
 		 886 aa  529  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  58.28 
 
 		 902 aa  528  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  56.7 
 
 		 836 aa  527  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  55.67 
 
 		 787 aa  524  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  57.3 
 
 		 796 aa  526  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  60.56 
 
 		 896 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  57.96 
 
 		 838 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  57.33 
 
 		 844 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  55.44 
 
 		 862 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  48.57 
 
 		 899 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  55.65 
 
 		 862 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  55.02 
 
 		 862 aa  515  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0032  preprotein translocase subunit SecA  56.47 
 
 		 935 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  55.13 
 
 		 881 aa  514  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  52.4 
 
 		 992 aa  516  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  57.68 
 
 		 859 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17671  preprotein translocase subunit SecA  57.08 
 
 		 945 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  55.76 
 
 		 968 aa  512  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  56.1 
 
 		 934 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  55.01 
 
 		 930 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  56.14 
 
 		 993 aa  511  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  54.29 
 
 		 845 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  54.4 
 
 		 934 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1420  protein translocase subunit SecA  55.15 
 
 		 935 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0249781 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  52.33 
 
 		 835 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30890  preprotein translocase subunit SecA  54.66 
 
 		 955 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  53.74 
 
 		 866 aa  509  9.999999999999999e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2124  preprotein translocase subunit SecA  56.3 
 
 		 930 aa  507  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1763  preprotein translocase, SecA subunit  56.9 
 
 		 872 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.639667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  52.33 
 
 		 835 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  57.21 
 
 		 868 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  55.46 
 
 		 884 aa  509  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  54.19 
 
 		 840 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  54.2 
 
 		 863 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  53.75 
 
 		 837 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>