More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0032 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1106  preprotein translocase subunit SecA  83.89 
 
 
935 aa  1576    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36933  predicted protein  57.75 
 
 
932 aa  1106    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00575996  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20951  preprotein translocase subunit SecA  67.27 
 
 
944 aa  1278    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.396844  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49779  predicted protein  42.44 
 
 
918 aa  704    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.894811  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  47.54 
 
 
945 aa  756    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0032  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
935 aa  1912    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3658  preprotein translocase subunit SecA  74.36 
 
 
932 aa  1444    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17671  preprotein translocase subunit SecA  68.12 
 
 
945 aa  1320    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  46.39 
 
 
980 aa  777    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18281  preprotein translocase subunit SecA  67.09 
 
 
943 aa  1301    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3269  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 
930 aa  1439    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659799  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1220  preprotein translocase subunit SecA  66.88 
 
 
942 aa  1263    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0984174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2124  preprotein translocase subunit SecA  74.28 
 
 
930 aa  1444    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0123  preprotein translocase subunit SecA  68.9 
 
 
937 aa  1330    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0081  preprotein translocase subunit SecA  68.98 
 
 
934 aa  1340    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1077  preprotein translocase subunit SecA  83.89 
 
 
935 aa  1578    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01511  preprotein translocase subunit SecA  67.59 
 
 
951 aa  1297    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1732  preprotein translocase subunit SecA  67.34 
 
 
943 aa  1302    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0289  preprotein translocase subunit SecA  73.12 
 
 
948 aa  1422    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  50.11 
 
 
896 aa  866    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  49.41 
 
 
957 aa  874    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  49.2 
 
 
958 aa  877    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1058  preprotein translocase subunit SecA  45.3 
 
 
869 aa  719    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.981267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  49.57 
 
 
1067 aa  753    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4635  preprotein translocase subunit SecA  74.52 
 
 
936 aa  1448    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226506  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2000  preprotein translocase, SecA subunit  44.44 
 
 
934 aa  744    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011814 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9327  nuclear-encoded-like protein of plastid sec  44.55 
 
 
935 aa  759    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18301  preprotein translocase subunit SecA  66.7 
 
 
943 aa  1269    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18491  preprotein translocase subunit SecA  66.84 
 
 
943 aa  1275    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  58.24 
 
 
899 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  59.2 
 
 
873 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  57.84 
 
 
897 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  59.35 
 
 
1009 aa  619  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  58.98 
 
 
888 aa  620  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  59.32 
 
 
994 aa  617  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  58.22 
 
 
894 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  58.74 
 
 
886 aa  615  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  56.31 
 
 
910 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  56.93 
 
 
899 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  57.39 
 
 
896 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  58.41 
 
 
896 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  58.17 
 
 
872 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  56.2 
 
 
912 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  57.31 
 
 
954 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  55.75 
 
 
897 aa  599  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  57.79 
 
 
1018 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  56.6 
 
 
903 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  55.96 
 
 
917 aa  596  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  55.53 
 
 
993 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  55.7 
 
 
932 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6305  preprotein translocase subunit SecA  57.96 
 
 
975 aa  594  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  58.51 
 
 
845 aa  594  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  57.41 
 
 
968 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  59.14 
 
 
834 aa  594  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  56.65 
 
 
910 aa  595  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  57.31 
 
 
903 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  55.68 
 
 
932 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  56.38 
 
 
866 aa  595  1e-168  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  59.41 
 
 
796 aa  595  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  57.03 
 
 
912 aa  593  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30890  preprotein translocase subunit SecA  56.82 
 
 
955 aa  595  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164673  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  56.58 
 
 
864 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  55.49 
 
 
931 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  56.43 
 
 
914 aa  591  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  55.6 
 
 
908 aa  591  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  55.3 
 
 
932 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  55.3 
 
 
932 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  54.99 
 
 
934 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  55.49 
 
 
931 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  55.3 
 
 
932 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  55.9 
 
 
914 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1387  preprotein translocase subunit SecA  55.49 
 
 
947 aa  588  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.606945  normal  0.598179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  55.9 
 
 
914 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1353  preprotein translocase subunit SecA  55.49 
 
 
947 aa  588  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0722843  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  58.74 
 
 
787 aa  586  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  54.94 
 
 
934 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  56.37 
 
 
909 aa  586  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1371  preprotein translocase subunit SecA  55.49 
 
 
947 aa  588  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.719275 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  56.43 
 
 
914 aa  588  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  56.14 
 
 
848 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1249  preprotein translocase, SecA subunit  54.89 
 
 
904 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  54.94 
 
 
931 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  54.94 
 
 
931 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  54.94 
 
 
931 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  54.94 
 
 
931 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  55.32 
 
 
930 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1822  preprotein translocase, SecA subunit  56.21 
 
 
906 aa  585  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  54.94 
 
 
931 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  56.18 
 
 
881 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3628  preprotein translocase, SecA subunit  54.38 
 
 
950 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0804577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09420  protein translocase subunit secA  57.12 
 
 
931 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.915131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  54.04 
 
 
944 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  54.94 
 
 
931 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7585  preprotein translocase subunit SecA  57.47 
 
 
928 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.614027 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  55.41 
 
 
836 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  54.94 
 
 
931 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  54.83 
 
 
992 aa  580  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 
936 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3807  preprotein translocase, SecA subunit  56.74 
 
 
895 aa  582  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0963816  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  56.41 
 
 
908 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>