244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1201 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1201  dehydratase  100 
 
 
477 aa  940    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.461457  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1317  hypothetical protein  23.48 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.82 
 
 
248 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.264822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.52 
 
 
249 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.52 
 
 
249 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.52 
 
 
249 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2429  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.54 
 
 
247 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047151  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.44 
 
 
246 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  28.43 
 
 
243 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
246 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
247 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.97 
 
 
249 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
248 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
255 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
248 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 
250 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.805502  normal  0.135775 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  39.13 
 
 
255 aa  54.3  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2158  glucose 1-dehydrogenase  46.55 
 
 
250 aa  54.3  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2069  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.82 
 
 
243 aa  53.9  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1613  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.28 
 
 
248 aa  53.9  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
246 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 
248 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0908582 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1043  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.08 
 
 
247 aa  53.5  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00108019  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0269  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.86 
 
 
247 aa  52.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2563  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
249 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.27 
 
 
249 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 
246 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 
246 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
246 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.0656338 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  43.75 
 
 
261 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.77 
 
 
248 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
246 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
261 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4160  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.21 
 
 
247 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.28 
 
 
248 aa  52  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1289  MaoC-like dehydratase  35.43 
 
 
149 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
239 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
246 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
248 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
246 aa  52  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 
246 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0231  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
247 aa  51.2  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06849  hypothetical protein  27.43 
 
 
243 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
254 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
246 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1361  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 
247 aa  51.2  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.70601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 
260 aa  51.2  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 
253 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  35.92 
 
 
140 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
249 aa  50.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3100  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.67 
 
 
247 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.012371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 
249 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.19 
 
 
249 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 
248 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1851  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.09 
 
 
259 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
248 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0671511 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
246 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20000  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
251 aa  50.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.332114  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  46 
 
 
134 aa  50.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1003  glucose-1-dehydrogenase  33.92 
 
 
253 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
254 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
250 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
254 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.65 
 
 
249 aa  50.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1482  glucose 1-dehydrogenase  44.83 
 
 
250 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.350696  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  30.59 
 
 
248 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  48.08 
 
 
248 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  42.65 
 
 
256 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
247 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0562  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
247 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
277 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0837629  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4359  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.91 
 
 
249 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
246 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1817  short chain dehydrogenase  30 
 
 
337 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4155  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.91 
 
 
249 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
261 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
285 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.1 
 
 
248 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.13 
 
 
262 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
247 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0613909  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  44 
 
 
134 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
256 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
254 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5033  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
253 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  40.62 
 
 
261 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0112  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.91 
 
 
249 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16629  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
254 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4227  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.91 
 
 
249 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0485  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
247 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
246 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2760  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
241 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3240  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
264 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.538223  normal  0.0864217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.36 
 
 
246 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
249 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 
245 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
253 aa  48.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1614  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.86 
 
 
253 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0547221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  41.51 
 
 
161 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0461  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
247 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1509  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
247 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>