86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2440 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  100 
 
 		 373 aa  717    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  38.69 
 
 		 371 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1485  putative transmembrane protein  48.56 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  39.83 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.02 
 
 		 373 aa  238  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  39.13 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.48 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  37.05 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.94 
 
 		 371 aa  232  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.81 
 
 		 371 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.17 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.57 
 
 		 371 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.84 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.03 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.75 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.04 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  34.26 
 
 		 420 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.07 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.5 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  37.36 
 
 		 357 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.72 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  32.99 
 
 		 421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.31 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.73 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32 
 
 		 374 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  35.47 
 
 		 351 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1966  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.23 
 
 		 421 aa  132  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  34.01 
 
 		 361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  34.8 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.62 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  32.37 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.69 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  33.24 
 
 		 363 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  33.91 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1528  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.54 
 
 		 368 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4955  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.19 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  31.59 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.63 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.69 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.39 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  31.44 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  29.1 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  30.54 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3923  hypothetical protein  31.55 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.554926 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4145  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.08 
 
 		 349 aa  86.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689999  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  26.78 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  27.91 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  27.91 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  26.79 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  27.91 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.7 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.23 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  26.95 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  27.37 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.09 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  24.78 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  24.78 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  29.14 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.57 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  29.54 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.82 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.18 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.65 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  38.94 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.33 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  41.9 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.66 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  33.94 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  31.67 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.2 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.67 
 
 		 183 aa  47.8  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  28.1 
 
 		 355 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  29.17 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.06 
 
 		 364 aa  47  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  38.66 
 
 		 353 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.09 
 
 		 409 aa  46.2  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.02 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  32.23 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  28.33 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.17 
 
 		 180 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  25.89 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  28.74 
 
 		 173 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  30.89 
 
 		 365 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.67 
 
 		 180 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  31.4 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>