71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3774 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 374 aa  724    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  61.6 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  53.18 
 
 		 366 aa  325  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  52.16 
 
 		 363 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.59 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4955  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52 
 
 		 370 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.14 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  46.55 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.06 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.53 
 
 		 364 aa  144  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  33.62 
 
 		 357 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.12 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.96 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  34.69 
 
 		 351 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.44 
 
 		 368 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.23 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.97 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  27.17 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  28.7 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.05 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.27 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.97 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  28.12 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.77 
 
 		 373 aa  99.8  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  32.72 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  29.15 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  30.84 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  28.26 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.02 
 
 		 330 aa  92.8  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.23 
 
 		 373 aa  90.5  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.82 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.29 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  26.2 
 
 		 420 aa  87.4  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3923  hypothetical protein  30.03 
 
 		 348 aa  86.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.554926 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  25.07 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  25.07 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4145  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.03 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689999  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  29.94 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.53 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  24.02 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.55 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  27.68 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1485  putative transmembrane protein  29.79 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.67 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1528  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.31 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.7 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.04 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  24.57 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  25.36 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  25.36 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  25.65 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  25.36 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  24.78 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.07 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1966  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.2 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.9 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  24.12 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  25.84 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  24.85 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  32.87 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.29 
 
 		 175 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  25.22 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  36.92 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  33.78 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.87 
 
 		 175 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.38 
 
 		 183 aa  44.3  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.94 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.84 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  24.84 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.29 
 
 		 181 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>