89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2224 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  836    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  68.94 
 
 		 423 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  66.27 
 
 		 420 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  59.34 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1966  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  54.37 
 
 		 421 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  40.42 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  40.51 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  39.37 
 
 		 371 aa  236  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  39.74 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.69 
 
 		 373 aa  226  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.31 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.58 
 
 		 371 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.62 
 
 		 373 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.51 
 
 		 373 aa  209  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.56 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.53 
 
 		 368 aa  202  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.14 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  29.12 
 
 		 357 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.18 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.98 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.24 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1485  putative transmembrane protein  32.51 
 
 		 374 aa  141  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.62 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  33.7 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.16 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  29.84 
 
 		 352 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.25 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  31.76 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  29.97 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.18 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3923  hypothetical protein  28.49 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.554926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  28.69 
 
 		 362 aa  100  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1528  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.33 
 
 		 368 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  28.12 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  28.09 
 
 		 361 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4145  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.18 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689999  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.68 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  27.6 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4955  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.3 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.57 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  27.15 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.36 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.56 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  26.63 
 
 		 394 aa  67  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  23.97 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  22.13 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  22.13 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.2 
 
 		 355 aa  57  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  22.43 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  30.83 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  30.83 
 
 		 352 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  30.83 
 
 		 352 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  30.83 
 
 		 352 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  30.83 
 
 		 352 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  30 
 
 		 349 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  32.03 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.6 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.7 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  22.84 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.98 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.41 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  34.78 
 
 		 173 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.82 
 
 		 334 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  31.86 
 
 		 359 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.19 
 
 		 406 aa  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  22.75 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.55 
 
 		 180 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.09 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.5 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  28.83 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.53 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  23.04 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  22.33 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  22.33 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.26 
 
 		 183 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.81 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  28.83 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  31.68 
 
 		 180 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5150  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.73 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00907952  normal  0.925389 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.71 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  33.68 
 
 		 175 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  29.11 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.85 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.78 
 
 		 176 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  27.82 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.64 
 
 		 216 aa  43.1  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0716  YeeE/YedE family protein  34.57 
 
 		 428 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>